Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-1B6SEH8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms