Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNIP3Q9Y2W7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms