Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf4Q9QZS2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf4Q9QZS2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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