Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms