Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms