Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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