Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL19A1Q14993 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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COL19A1Q14993 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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COL19A1Q14993 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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