Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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