Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCAO15360 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCAO15360 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCAO15360 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCAO15360 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCAO15360 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms