Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT172Q9UG01 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms