Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms