Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Cldn34c1Q8K193 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn34c1Q8K193 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn34c1Q8K193 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn34c1Q8K193 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn34c1Q8K193 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn34c1Q8K193 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn34c1Q8K193 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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