Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms