Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRP12270 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRP12270 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms