Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms