Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NPIPB13A6NJU9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms