Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms