Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms