Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms