Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms