Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms