Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Scn4bQ7M729 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Scn4bQ7M729 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Scn4bQ7M729 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Scn4bQ7M729 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Scn4bQ7M729 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scn4bQ7M729 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms