Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc8eQ66JT1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms