Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms