Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMDP50402 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMDP50402 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMDP50402 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMDP50402 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMDP50402 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMDP50402 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMDP50402 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms