Protein–RNA interactions for Protein: P17181

IFNAR1, Interferon alpha/beta receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNAR1P17181 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFNAR1P17181 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFNAR1P17181 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms