Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ddx60E9PZQ1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ddx60E9PZQ1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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