Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms