Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Nectin3Q9JLB9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Nectin3Q9JLB9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Nectin3Q9JLB9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Nectin3Q9JLB9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Nectin3Q9JLB9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Nectin3Q9JLB9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Nectin3Q9JLB9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Nectin3Q9JLB9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Nectin3Q9JLB9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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