Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tuba8Q9JJZ2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms