Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms