Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms