Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC10Q01780 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms