Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3BP58499 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM3BP58499 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM3BP58499 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM3BP58499 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM3BP58499 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM3BP58499 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM3BP58499 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM3BP58499 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM3BP58499 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM3BP58499 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM3BP58499 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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