Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms