Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms