Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim7Q923T7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim7Q923T7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms