Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms