Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5218F6YH22 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms