Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Samd1D3YXK1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd1D3YXK1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms