Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACVR1Q04771 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACVR1Q04771 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms