Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms