Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms