Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod3Q9R0E1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms