Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms