Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q3U595 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q3U595 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U595 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U595 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U595 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U595 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U595 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U595 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U595 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U595 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U595 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q3U595 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms