Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRS1Q15050 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms