Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACLYP53396 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACLYP53396 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACLYP53396 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACLYP53396 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACLYP53396 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACLYP53396 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACLYP53396 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACLYP53396 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms