Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uso1Q9Z1Z0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Uso1Q9Z1Z0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uso1Q9Z1Z0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms