Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D8

Zkscan5, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 5, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan5Q9Z1D8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zkscan5Q9Z1D8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan5Q9Z1D8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan5Q9Z1D8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan5Q9Z1D8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan5Q9Z1D8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan5Q9Z1D8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan5Q9Z1D8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan5Q9Z1D8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zkscan5Q9Z1D8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms